京都市内发现一具男尸体。死因是侧头部受伤，但现场却无一丝血迹。尸体被认为是从别处转移过来的。神麻梨子等京都府警科搜查研究所，俗称“科搜研”，的成员们和新加入的宇佐见裕也一起展开鉴定行动。从尸体里残留的细微的抓痕鉴定出尸体身份是专家岸田康弘。京都府的土门刑警等人在搜查岸田的公寓时发现他私藏了塑料炸弹的原料。不久，便从这些原料上发现了除岸田以外的指纹。这个指纹就是上个月入侵机场的扩张工事事务所被逮捕的女人——有村启子。启子释放后的行踪不明，从她的房间里发现引爆装置。她被怀疑持有装有引爆装置的炸弹。麻梨子等人追踪她行踪，发现她可能乘上了以神户港为基点周游于大阪湾的大型餐馆游轮。麻梨子和土门等人乘上了这艘游船。另一方面，继续留在科搜研的宇佐见觉察到了了重大的事——启子打算在旅馆船内引爆炸弹。时限五分钟！麻梨子等人发现了炸弹。能否使众多乘客们安全撤离即将引爆的游船呢……。